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本文標(biāo)題:檢測消耗甲醇的微生物的技術(shù)分析顯微鏡

信息分類:行業(yè)動態(tài) 新聞來源:未知 發(fā)布時間:2018-5-12 21:05:36
檢測消耗甲醇的微生物的技術(shù)分析顯微

由于未培養(yǎng)微生物PLFA配體未知,所以PLFA分子沒有像核酸分子一樣作
為生物標(biāo)記。因此,如今大多數(shù)的SIP用同位素標(biāo)記DNA或RNA研究系統(tǒng)
發(fā)育。由于各種DNA都帶有鳥嘌呤和胞嘧啶(GC),結(jié)合同位素(例如,¨
C)的DNA標(biāo)記比未標(biāo)記的(例如,12C)DNA密度大,可以與未標(biāo)記的分開
。最終對用PCR一引物擴增出的經(jīng)過標(biāo)記的16S rDNA進(jìn)行克隆測序來鑒
定代謝相關(guān)基因。另外,PCR能擴增那些可能在催化代謝培養(yǎng)基中起著
重要作用的基因。DNA—SIP是第一個用于檢測消耗甲醇的微生物的技術(shù)
(Radajewski等,2000)。這個最初的研究是通過人造高濃度培養(yǎng)基和長
時間的培養(yǎng)(40d左右),這樣長時間培養(yǎng)可能也導(dǎo)致了中間或依靠初級
產(chǎn)物產(chǎn)生的次級標(biāo)記的產(chǎn)物。可是如果對(共)生長相互作用感興趣,這
可能有用。在RNA基礎(chǔ)上的SIP能在很大程度上解決這個問題。不管是以
初級消耗或下游的交叉供養(yǎng)為目標(biāo),SIP技術(shù)中13C標(biāo)記的DNA能夠克隆
建庫。不像磁電機一FISH技術(shù)是基于16S系統(tǒng)發(fā)育富集目標(biāo)基因組,DNA
—SIP技術(shù)能在特定培養(yǎng)基中以自身DNA為基礎(chǔ)富集目標(biāo)基因組。為了更
全面地了解近年DNA和RNA SIP的綜述,

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